植物内生菌作为植物微生态系统的一个重要组成部分，在与宿主植物长期协同进化过程中，形成了密切的互利共生关系，对于植物生长发育、次生代谢产物的积累等具有重要的促进作用。但是目前，有关内生菌对宿主的促生分子机制仍不明确。因此本课题组以前期从掌叶大黄根部分离出的一株内生桔绿木霉（Trichoderma citrinoviride）HT-1为研究材料，测定其对掌叶大黄幼苗生长发育和有效成分积累的影响，并利用转录组学手段揭示菌株HT-1促生分子机理。结果表明，经内生菌HT-1处理后，可以显著地促进掌叶大黄生长发育和有效成分（蒽醌类物质）积累。转录组分析表明，菌株HT-1主要通过影响植物激素信号转导、苯丙素合成、次级代谢产物合成、植物与病原菌互作等与植物生长发育密切相关的代谢通路中相关基因的差异表达，从而促进植物的生长发育、有效成分的积累。本研究结果为揭示药用植物与内生菌互作机制提供了一定的理论依据。
该研究受国际期刊International Journal of Molecular Sciences （IF: 6.208，中科院2区Top），Special Issue“Impact of Biotic/Abiotic Stress Factors on Plant Specialized Metabolites”专题约稿，于2022年10月28日在线发表，题目为“Molecular Traits Underlying the Growth Promotion and Metabolite Accumulation in Rheum palmatum Inoculated with Endophytic Trichoderma citrinoviride HT-1”。陈大为博士为论文的第一作者，孙坤教授为论文通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、省级人才发展专项资金、甘肃省科技计划等项目的资助。
论文链接：https://doi.org/10.3390/ijms232113132