我院青年教师达玲玲搭建了玫瑰功能基因组分析平台

时间:2023-10-24浏览:54设置

我院青年教师达玲玲搭建了玫瑰功能基因组分析平台RoseAPwww.gzybioinformatics.cn/RoseAP/index.php,该平台通过整合和分析基因组和转录组数据提高了玫瑰基因的注释率。首先,利用多种算法和规则对38815个基因进行了功能和结构上的标注,覆盖了97.76%的编码基因。其次,整合分析33个转录组样本,并基于PCCMR算法构建共表达网络,覆盖74.7%的编码基因。RoseAP平台中,用户可以通过输入基因id,获得其序列、结构、功能注释、表达谱、调控网络和功能模块信息。此外,还提供了BLAST、基因集富集分析、同源基因转换、基因序列提取、基因表达值提取、JBrowse基因组浏览器等辅助分析工具。该平台对玫瑰基因进行再注释,并实现在线查询分析。欢迎相关研究人员访问使用,以促进对玫瑰基因功能的挖掘和遗传改良。


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